Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CntfP51642 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CntfP51642 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CntfP51642 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CntfP51642 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CntfP51642 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CntfP51642 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CntfP51642 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CntfP51642 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CntfP51642 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CntfP51642 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CntfP51642 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CntfP51642 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CntfP51642 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CntfP51642 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CntfP51642 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CntfP51642 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CntfP51642 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CntfP51642 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms