Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LtbrP50284 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LtbrP50284 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LtbrP50284 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LtbrP50284 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LtbrP50284 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LtbrP50284 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms