Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5P49615 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5P49615 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms