Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtpreP49446 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtpreP49446 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpreP49446 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtpreP49446 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtpreP49446 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtpreP49446 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpreP49446 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpreP49446 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PtpreP49446 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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