Protein–RNA interactions for Protein: P49282

Slc11a2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc11a2P49282 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc11a2P49282 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc11a2P49282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc11a2P49282 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms