Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ercc3P49135 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc3P49135 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc3P49135 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms