Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl13P47963 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl13P47963 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms