Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PfkmP47857 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PfkmP47857 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PfkmP47857 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms