Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SrprbP47758 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SrprbP47758 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SrprbP47758 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms