Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax9P47242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pax9P47242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms