Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brcc3P46737 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brcc3P46737 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brcc3P46737 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms