Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ItgavP43406 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ItgavP43406 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ItgavP43406 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ItgavP43406 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ItgavP43406 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms