Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc1a2P43006 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc1a2P43006 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms