Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HttP42859 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HttP42859 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HttP42859 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HttP42859 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HttP42859 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HttP42859 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HttP42859 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HttP42859 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HttP42859 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HttP42859 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HttP42859 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HttP42859 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HttP42859 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HttP42859 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HttP42859 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HttP42859 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HttP42859 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HttP42859 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HttP42859 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HttP42859 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HttP42859 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HttP42859 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HttP42859 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HttP42859 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HttP42859 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HttP42859 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HttP42859 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HttP42859 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HttP42859 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HttP42859 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms