Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf9P41274 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf9P41274 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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