Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox7P40646 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox7P40646 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox7P40646 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms