Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ThpoP40226 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ThpoP40226 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms