Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TpoP35419 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TpoP35419 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TpoP35419 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TpoP35419 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TpoP35419 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TpoP35419 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TpoP35419 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TpoP35419 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TpoP35419 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TpoP35419 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms