Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sftpa1P35242 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sftpa1P35242 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 786.4 ms