Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nedd1P33215 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nedd1P33215 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nedd1P33215 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms