Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Saa4P31532 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Saa4P31532 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms