Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxa11P31311 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa11P31311 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms