Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Hoxa2P31245 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Hoxa2P31245 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa2P31245 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms