Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VtnP29788 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VtnP29788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VtnP29788 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VtnP29788 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VtnP29788 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VtnP29788 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VtnP29788 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VtnP29788 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VtnP29788 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VtnP29788 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VtnP29788 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VtnP29788 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VtnP29788 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VtnP29788 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VtnP29788 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms