Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TbpP29037 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TbpP29037 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TbpP29037 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TbpP29037 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TbpP29037 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TbpP29037 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TbpP29037 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TbpP29037 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TbpP29037 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TbpP29037 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TbpP29037 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TbpP29037 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TbpP29037 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TbpP29037 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TbpP29037 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TbpP29037 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TbpP29037 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms