Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PtprmP28828 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PtprmP28828 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprmP28828 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprmP28828 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprmP28828 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprmP28828 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprmP28828 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprmP28828 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprmP28828 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprmP28828 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprmP28828 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprmP28828 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprmP28828 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
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