Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mep1aP28825 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mep1aP28825 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms