Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kif5cP28738 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kif5cP28738 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kif5cP28738 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kif5cP28738 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kif5cP28738 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kif5cP28738 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms