Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxd9P28357 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxd9P28357 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms