Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa3P28310 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa3P28310 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa3P28310 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa3P28310 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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