Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtsgP28293 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CtsgP28293 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtsgP28293 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms