Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aco1P28271 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aco1P28271 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aco1P28271 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aco1P28271 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Aco1P28271 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Aco1P28271 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aco1P28271 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms