Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gjb1P28230 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gjb1P28230 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gjb1P28230 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gjb1P28230 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms