Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gjc1P28229 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gjc1P28229 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms