Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lef1P27782 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lef1P27782 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms