Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2afxP27661 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2afxP27661 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afxP27661 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afxP27661 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afxP27661 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2afxP27661 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2afxP27661 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms