Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PdgfraP26618 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfraP26618 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms