Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Itgb7P26011 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb7P26011 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms