Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NfyaP23708 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NfyaP23708 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NfyaP23708 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NfyaP23708 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfyaP23708 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NfyaP23708 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms