Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tsta3P23591 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tsta3P23591 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tsta3P23591 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tsta3P23591 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tsta3P23591 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms