Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja1P23242 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gja1P23242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gja1P23242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gja1P23242 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms