Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Eif3aP23116 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif3aP23116 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif3aP23116 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms