Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pou3f1P21952 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou3f1P21952 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms