Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcer1aP20489 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fcer1aP20489 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms