Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P20040 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P20040 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P20040 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P20040 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P20040 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P20040 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P20040 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P20040 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P20040 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P20040 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P20040 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P20040 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P20040 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P20040 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P20040 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P20040 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P20040 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P20040 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P20040 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P20040 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P20040 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P20040 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P20040 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms