Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc1P18828 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdc1P18828 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms