Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Selenbp1P17563 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Selenbp1P17563 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms