Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CnpP16330 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CnpP16330 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CnpP16330 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CnpP16330 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CnpP16330 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CnpP16330 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CnpP16330 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CnpP16330 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CnpP16330 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CnpP16330 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CnpP16330 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CnpP16330 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CnpP16330 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CnpP16330 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CnpP16330 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CnpP16330 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CnpP16330 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CnpP16330 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CnpP16330 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CnpP16330 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CnpP16330 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CnpP16330 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CnpP16330 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms