Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col1a1P11087 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col1a1P11087 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms