Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spp1P10923 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Spp1P10923 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spp1P10923 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms